В системе дополнительного образования г. Южно-Сахалинска начала развиваться с 1956 года с открытия на базе средней школы № 9 ДЮСШ № 1. Это была первая и единственная на то время спортивная школа. Базой ее стал спортивный зал школы, построенный ещё японцами в 1928 году. Штатных работников не было: работали тренеры-совместители по легкой атлетике, лыжным гонкам, боксу, гимнастике, велоспорту, баскетболу. Занятия проходили, как на базе школы № 9, так и в спортивных залах «Строитель», «Спартак» (старый зал, район СОШ № 1), «Локомотив».
С приездом молодых специалистов из г. Ростова, г. Краснодара, г. Иваново в 1963-1964 годах спортивная школа постепенно преобразовалась в школу спортивных игр.
В 1968 году после ввода в эксплуатацию нового здания средней школы № 9, ДЮСШ получила в собственное пользование спортивный зал школы, что и стало её базой, а приоритеты в развитии получил баскетбол.
С 1956 по 1993 годы школа находилась в ведении городского отдела образования.
С августа 1993 года была передана на баланс отдела по физической культуре и спорту администрации г. Южно-Сахалинска и стала ДЮСШ по баскетболу.
С 1999 года школа переименована в муниципальное учреждение дополнительного образования спортивной направленности ДЮСШ по баскетболу.
С октября 2002 года переименовано в Муниципальное образовательное учреждение дополнительного образования детей ДЮСШ по баскетболу.
В 2007 г. школа переименована в Муниципальное образовательное учреждение дополнительного образования детей ДЮСШ игровых видов спорта г. Южно-Сахалинска в связи с открытием дополнительных отделений: волейбол и настольный теннис.
В 2008 году было открыто отделение футбола.
В 2010 году открыто отделение пулевой стрельбы.
На основании приказа управления по физической культуре, спорту и молодежной политике администрации города Южно-Сахалинска от 29.04.2011 № 160 «О проведении организационных мероприятий по закрытию отделения шахмат в МОУ ДОД ДЮСШ игровых видов спорта.
В 2011 году учреждение переименовано в Муниципальное бюджетное образовательное учреждение дополнительного образования детей детско-юношеская спортивная школа игровых видов спорта г. Южно-Сахалинска.
В разные годы школой руководили: И.М. Виленский (1956-1958 гг.), Н. Фокин (1958-1960 гг.),
Е.И. Винник (1961-1968 гг.), Б.П.Патлатюк (1969-1973 гг.), А.Д.Бондаренко (1973-1974гг.), Н.А.Холопова (1974-1975 гг.) Н.А.Шариков (1975-1978 гг.) Г.М. Бедняков (1978-1994 гг.), Ю.М. Кочетов (апрель-август 1994 г.), В.Г. Панасевич (1994-1995 гг.), В.В.Воднев (апрель-декабрь 1995 г.), В.Е. Шур январь 1996-май 1997 гг.) Н.А.Холопова (май-ноябрь 1997 г.) С ноября 1997 года по январь 2008 г. С.А.Пронкин.
Тренерами по баскетболу являлись Е.М.Фридман, Е.И.Винник, Г.М. Бедняков, Г.Н. Кисляк, Л.А. Логинова, Л.А. Герцулин, Н.М. Логинова,, Н.А.Холопова, Г.С.Захаров, А.М. Сухобрусов, В.В. Наймушина, Т.А. Шушунова, Ю.Н.Солодухин, В.В.Воднев, Н.С. Моисеев,В.Н. Лисовский, В.Е. Шур, Н.Ю.Кочетова.
Команды СШ побеждали своих соперников не только в Сахалинской области, но и далеко за ее пределами и считались одними из сильнейших команд Дальнего Востока по баскетболу.